物質・材料の構造秩序を抽出するためのPythonパッケージおよびグラフィカルユーザーインターフェース。原子構造データから、多面体、リング、空隙など様々な構造的特徴を抽出することができる。また、2体分布関数や角度分布に加えて、中性子回折やX線回折で得られる構造因子のシミュレーションにも対応する。
オープンソースの分子動力学計算アプリケーション。生体高分子や溶媒などの多数の分子・原子からなる系の分子動力学シュミレーションを実行できる。多くの力場セット・アルゴリズムを実装しており、OpenMPによる並列計算にも対応。Javaによるグラフィカルユーザーインターフェース(GUI)も付属している。
溶媒を連続体モデル（陰溶媒モデル）として取り扱った第一原理計算を行うためのアプリケーション。VASPへのパッチとして公開されている。分子動力学計算や、nudged elastic band法による溶媒中の反応障壁への計算に対応する。