物質科学シミュレーションのポータルサイト

1. はじめに Materials Projectとも連動しているpythonライブラリ pymatgenでは、さまざまな物質の特性を取り扱える便利なクラスが整備されている。その取り扱いやすさと充実した公式ドキュメントの…続きを読む

はじめに MateriApps LIVE!にプレインストールされたQuantum Espressoで誘電率を計算してみます。環境はVirtualbox上で動かしているMateriApps LIVE! 3.3です。Virt…続きを読む

1. はじめに 分子動力学ソフトLAMMPSを用いて、ソフトマターの問題を取り扱うことが可能です。特に膜などの構造が形成される様子をシミュレーションして可視化すると、印象的な動画を比較的簡単に作成することができます。ここ…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Big Sur)にQuantum ESPRESSOをインストールする方法について解説します 2. Hom…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Big Sur)にHPhiをインストールする方法について解説します 2. Homebrewのインストール…続きを読む

概要 OpenMXはフリーで使える第一原理電子状態計算コードです。日本語ドキュメントが充実しており、物性研スパコン(ohtaka)にもプリインストールされています。局在基底を用いており、O(N)法を用いた大規模計算や表面…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、LinuxOS 上でMateriApps Installer を利用して、MateriApps Installerに含まれるソフトウェア(ALPS, Quantum ESPRESSO, …続きを読む

1. はじめに XenonPyは機械学習を用いて物質探索を行うためのPythonツールです。ここでは、最新のMateriApps3.2環境でXenonPy実行環境を整え、PyTorchを用いた物性値の予測モデルの学習を行…続きを読む

1. はじめに blueqatはPythonで書かれた量子ゲートシミュレータで、オープンソースのソフトウェアとなっています。ここでは、単純な最適化問題をblueqatを用いて解いてみます。 2. インストール・コンパイル…続きを読む

1. はじめに Quantum ESPRESSO (QE)を用いて第一原理計算を行うには、結晶構造について事前に情報を取得しておく必要があります。すでにGaAsの第一原理計算について紹介していますが、一般に物質の構造は複…続きを読む