物質科学シミュレーションのポータルサイト

1. はじめに Crystallography Open Database (COD)は結晶構造についてのオープンアクセスのデータベースです。2022/1/1現在48万もの結晶構造データがあり、自由に利用する事が出来ます…続きを読む

1.はじめに GAMESSは非経験的量子化学計算を行うソフトウェアで、アイオワ州立大学のGordonとSchmidtらによって開発されたものです。無償配布されていますが、再配布は禁じられています。 https://www…続きを読む

1.はじめに SALMONは、物質に電磁場が入射された際の電子のダイナミクスを計算するアプリです。線形応答から外れるような強い外場下での電子の応答や、それに付随する電磁場の変化についてもシミュレーションを行うことができま…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、MateriApps Installerを使って、CentOS 7にQuantum ESPRESSOをインストールする方法について解説します。ここでは、インストールに必要なツールやライブ…続きを読む

1. はじめに Materials Projectとも連動しているpythonライブラリ pymatgenでは、さまざまな物質の特性を取り扱える便利なクラスが整備されている。その取り扱いやすさと充実した公式ドキュメントの…続きを読む

はじめに MateriApps LIVE!にプレインストールされたQuantum Espressoで誘電率を計算してみます。環境はVirtualbox上で動かしているMateriApps LIVE! 3.3です。Virt…続きを読む

1. はじめに PHYSBOはCOMBOを元に開発されたベイズ最適化パッケージです。高速でスケーラブルなベイズ最適化を行うことができ、多くのデータ量を取り扱うことができるのが特徴です。PHYSBOはPythonライブラリ…続きを読む

1. はじめに 分子動力学ソフトLAMMPSを用いて、ソフトマターの問題を取り扱うことが可能です。特に膜などの構造が形成される様子をシミュレーションして可視化すると、印象的な動画を比較的簡単に作成することができます。ここ…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Sonoma)にQuantum ESPRESSOをインストールする方法について解説します 2. Home…続きを読む

1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Big Sur)にHPhiをインストールする方法について解説します 2. Homebrewのインストール…続きを読む