Quantum EspressoでGaAsの誘電率を計算する
はじめに MateriApps LIVE!にプレインストールされたQuantum Espressoで誘電率を計算してみます。環境はVirtualbox上で動かしているMateriApps LIVE! 3.3です。Virt…続きを読む
Physboを使った結晶構造最適化
1. はじめに PHYSBOはCOMBOを元に開発されたベイズ最適化パッケージです。高速でスケーラブルなベイズ最適化を行うことができ、多くのデータ量を取り扱うことができるのが特徴です。PHYSBOはPythonライブラリ…続きを読む
分子動力学ソフトLAMMPSを用いたミセル自己形成のシミュレーション
1. はじめに 分子動力学ソフトLAMMPSを用いて、ソフトマターの問題を取り扱うことが可能です。特に膜などの構造が形成される様子をシミュレーションして可視化すると、印象的な動画を比較的簡単に作成することができます。ここ…続きを読む
MateriApps Installerを使ってmacOSにQuantum ESPRESSOをインストールする
1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Sonoma)にQuantum ESPRESSOをインストールする方法について解説します 2. Home…続きを読む
MateriApps Installerを使ってmacOSにHPhiをインストールする
1. はじめに このレビューでは、HomebrewとMateriApps Installerを使って、macOS (Big Sur)にHPhiをインストールする方法について解説します 2. Homebrewのインストール…続きを読む
OpenMXのohtaka(物性研スパコン)での使用例
概要 OpenMXはフリーで使える第一原理電子状態計算コードです。日本語ドキュメントが充実しており、物性研スパコン(ohtaka)にもプリインストールされています。局在基底を用いており、O(N)法を用いた大規模計算や表面…続きを読む
MateriApps Installerを使ってLinux環境にアプリをインストールする(gcc利用)
1. はじめに このレビューでは、LinuxOS 上でMateriApps Installer を利用して、MateriApps Installerに含まれるソフトウェア(ALPS, Quantum ESPRESSO, …続きを読む
XenonPyとPyTorchを用いた物性値予測モデルの学習
1. はじめに XenonPyは機械学習を用いて物質探索を行うためのPythonツールです。ここでは、最新のMateriApps3.2環境でXenonPy実行環境を整え、PyTorchを用いた物性値の予測モデルの学習を行…続きを読む
blueqatを用いた最適化問題の解き方
1. はじめに blueqatはPythonで書かれた量子ゲートシミュレータで、オープンソースのソフトウェアとなっています。ここでは、単純な最適化問題をblueqatを用いて解いてみます。 2. インストール・コンパイル…続きを読む
Quantum ESPRESSOと物質データベースを利用した電子状態計算
1. はじめに Quantum ESPRESSO (QE)を用いて第一原理計算を行うには、結晶構造について事前に情報を取得しておく必要があります。すでにGaAsの第一原理計算について紹介していますが、一般に物質の構造は複…続きを読む