SOVA (Structural Order Visualization and Analysis tools)

[ソヴァ]

物質・材料の構造秩序を抽出するためのPythonパッケージおよびグラフィカルユーザーインターフェース。原子構造データから、多面体、リング、空隙など様々な構造的特徴を抽出することができる。また、2体分布関数や角度分布に加えて、中性子回折やX線回折で得られる構造因子のシミュレーションにも対応する。

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利用環境	GUI: Windows/MacOS CUI: Python環境が必要
開発者	Motoki Shiga (Tohoku Univ.)
対象となる物質・モデル	液体ガラス結晶
文献	(Anisotropic ring analysis) M. Shiga, A. Hirata, Y. Onodera, H. Masai, Ring-originated anisotropy of local structural ordering in amorphous and crystalline silicon dioxide. Commun. Mater. 4, 91 (2023). https://doi.org/10.1038/s43246-023-00416-w (Cavity analysis) I. Meyer, F. Rhiem, F. Beule, D. Knodt, J. Heinen, R. O. Jones, pyMolDyn: Identification, structure, and properties of cavities/vacancies in condensed matter, J. Comput. Chem., 38, 389–394 (2017). https://doi.org/10.1002/jcc.24697
その他	Github repository for sovapy (CUI): https://github.com/MotokiShiga/sova-cui