ERmodチュートリアル:エネルギー表示法による溶液系・ナノ不均一弱秩序系の全原子自由エネルギー計算
簡易チュートリアル
https://sourceforge.net/p/ermod/wiki/QuickStartGuide/
公式サイトへのリンク
https://sourceforge.net/projects/ermod/
入力・出力形式
簡易チュートリアルに説明があります。また、vmdpluginがサポートしている形式であれば、trajectory readingが可能です。