OVITO

公開度：3 ★★★
ドキュメント充実度：3 ★★★

分子動力学用に開発された原子・分子の可視化のためのオープンソースアプリケーション。多くの種類の分子配置ファイルに対応しており、原子・分子の可視化やアニメーション作成を行うことができる。多くの解析ツールを有することが特徴で、グラフィカルユーザーインターフェイス(GUI)による直観的な操作で様々な処理が可能。

基本情報

公式サイト

https://ovito.org/

ライセンス

GNU GPL Version 3 本アプリケーションを用いた研究成果を論文に発表するときには、下記の参考文献を引用すること。また可能であれば、公式サイトのURLも引用すること。

利用環境	Unix/Linux, Windows, Macのバイナリが配布されている OpenGL 2.1以上が必要, ソースコード(C++11)も下記URLより入手可能 https://gitlab.com/stuko/ovito
関連アプリ	CASTEP FHI-aims HOOMD-blue LAMMPS Protein Data Bank (PDB) VASP
関連キーワード	古典分子動力学法
文献	"Visualization and analysis of atomistic simulation data with OVITO - the Open Visualization Tool", A. Stukowski, Modelling Simul. Mater. Sci. Eng. 18 (2010), 015012.
その他	対応アプリ・入力フォーマット CASTEP: MD/GEOMファイル(.md, .geom), Cellファイル(.cell) FHI-aims: Geometryファイル HOOMD-blue: GSD/HOOMDファイル IMD: IMDファイル AtomEye: CFCファイル LAMMPS: データファイル, バイナリダンプファイル, テキストダンプファイル PDB: PDBファイル(.pdb) VASP: POSCARファイル, XDATCARファイル, CHGCARファイル VTK: VTKファイルその他フォーマット: NetCDFファイル, XYZファイル(*.xyz)

基本情報

公式サイト

ライセンス

対応アプリ・入力フォーマット