LAMMPS の MateriApps LIVE! での体験記(2018.6.16)
Last Update:2021/12/09
LAMMPS(11 Aug 2017)を MateriApps LIVE!上で実行してみた。
準備:
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MateriApps LIVE! の利用の詳細は、MaterApps LIVE! の Wiki を参照する。
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LAMMPSのサンプルの入力ファイルは、MateriApps LIVE!の /usr/share/doc/lammps-doc/examples/ にある
実行例:
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サンプルの入力ファイル /usr/share/doc/lammps-doc/examples/melt/in.melt(FCC格子状に並んだLJ粒子)を実行する。 $ lammps -in in.melt
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次に可視化用のファイルを出力するように入力ファイル in.melt を修正する。 in.melt のコピーを取り、in.melt_dump を作成する。 $ cp in.melt in.melt_dump in.melt_dump において、 #dump id all atom 50 dump.melt の#を取って、 dump id all atom 50 dump.melt とする。
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修正した in.melt_dump を実行する。 $ lammps -in in.melt_dump 出力された dump.melt を可視化ツールVMDを用いて表示する。