基本情報 Last Update:2022/03/07
公式サイト
ライセンス
ABINIT-MPのOpenシリーズのご利用、あるいは開発系コンソーシアムにご関心のある方は、立教大学の望月祐志（fullmoon -at- rikkyo.ac.jp）にメールにてご連絡いただければと思います（-at-を@に変換してください）。ご所望の利用形態に応じて、個別に契約書面の取り交わしをさせていただき、ご提供します（Ver. 1 Rev. 22）。
| 利用環境 | Intel IA64系, 富士通 FX系, Windows系, NEC SX系 |
|---|---|
| 開発者 | 望月祐志*（立教大学 理学部）, 中野達也（国立医薬品食品衛生研究所 医薬安全科学部）, 坂倉耕太（計算科学振興財団）, 渡邊啓正（HPCシステムズ）, 佐藤伸哉（NECソリューションイノベータ）, 奥脇弘次（立教大学 理学部） （*ABINIT-MP取り纏め責任者） |
| 対象となる物質・モデル | タンパク質, タンパク質複合体, タンパク質-薬品分子複合系, 水和凝集系, 分子固体, 結晶モデル（有バンドギャップ） |
| 求められる物理量 | エネルギー（HF, MP2, MP3, CCSD(T)）, 力（HF, MP2）, 電子密度（HF, MP2） |
| 手法 | フラグメント分子軌道（FMO）法（4体展開まで） |
| 並列化対応 | OpenMP/MPIハイブリッド並列 |
| 関連キーワード | |
| 文献 | [1]“Electron-correlated fragment-molecular-orbital calculations for biomolecular and nano systems”, S. Tanaka, Y. Mochizuki, Y. Komeiji, Y. Okiyama, K. Fukuzawa, Phys. Chem. Chem. Phys. 16 (2014) 10310-10344. [2] “The ABINIT-MP Program”, Y. Mochizuki, T. Nakano, K. Sakakura, Y. Okiyama, H. Watanabe, K. Kato, Y. Akinaga, S. Sato, J. Yamamoto, K. Yamashita, T. Murase, T. Ishikawa, Y. Komeiji, Y. Kato, N. Watanabe, T. Tsukamoto, H. Mori, K. Okuwaki, S. Tanaka, A. Kato, C. Watanabe, K. Fukuzawa (pp.53-67) in “Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method – Enhanced Performance and Applicability”, ed. by Y. Mochizuki, S. Tanaka, K. Fukuzawa, (2021, Springer, Singapore). |
| その他 | 4体フラグメント展開までが可能な使いやすいFMOプログラム。特別な設定なしに、Linux/Intel系サーバに標準搭載されているMPI環境で動作する。HPCI拠点では、｛北大, 東北大, 東大, 東工大, 海洋機構, 名大, 分子研, 阪大, R-CCS, 九大｝でライブラリプログラムとして利用可能。Ver. 2系のA64FX向け高速化と大規模系対応は、名大の片桐・大島研究室とのコラボレーションで進行中。 |