基本情報
Last Update:2021/03/06
公式サイト
ライセンス
GAMESSのライセンス
登録時に同意 http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/License_Agreement.html
| 利用環境 | PCクラスター(RedHat系のOS) 詳しくは https://staff.aist.go.jp/d.g.fedorov/fmo/GAMESS-FMO_J.pdf |
|---|---|
| 開発者 | 石村和也（分子科学研究所）、河東田道夫（分子科学研究所）、永瀬茂（分子科学研究所）、Dmitri G. Fedorov（産業技術総合研究所）、石田豊和（産業技術総合研究所）、千葉真人（産業技術総合研究所）、永田武史（産業技術総合研究所）、梅田宏明（筑波大学 大学院システム情報工学研究科）、北浦和夫（神戸大学 大学院システム情報学研究科） |
| 対象となる物質・モデル | タンパク質、DNA/RNA、生体高分子、有機低分子化合物との複合体、分子集合体 |
| 求められる物理量 | 全エネルギー、エネルギー勾配、Mulliken population、フラグメント間相互作用エネルギー（PIE)とその成分（PIEDA)、電子密度分布（cubeファイルとして出力）、連続誘電体モデルhttp://ccms.sakura.ne.jp/materiapps/wp-admin/post-new.php?post_type=appによる溶媒和自由エネルギー、電子励起エネルギー |
| 手法 | フラグメント分子軌道法（FMO法） |
| 並列化対応 | MPI並列に対応(GAMESS独自のインタフェースDDIをラッパーとして利用)。 |
| 関連アプリ | |
| 関連キーワード | |
| 文献 | D. G. Fedorov, K. Kitaura, J. Phys. Chem. A, 111, 6904-6914 (2007). |
| その他 | 全系を小さなフラグメントに分割し、フラグメントとフラグメントペアについてab initio MOの計算を行い、それらの結果を用いて全系のプロパティを計算する。計算時間はシステムサイズにほぼ比例する。 GAMESS: http://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/ |