物材機構の木野氏により、scikit-learnを用いたマテリアルズインフォマティクスのチュートリアルが整備されています

• https://bitbucket.org/kino_h/mi_python_tutorial_2020_public/

ここでは、MateriApps LIVE!上でチュートリアルを実行するために必要な環境整備とチュートリアルの実行方法について解説します

使用したバージョン:

• MateriApps LIVE! バージョン 2.4 (Debian Stretch, Python 3.5.3)
• scikit-learn 0.18

必要ツール類のインストール:

• unzip, pandas, seaborn

  $ sudo apt install zip python3-pandas python3-seaborn

• cython

  $ sudo pip3 install cython

• pybtex, pymatgen, pymc3

  $ sudo pip3 install pybtex pymatgen pymc3==3.6

• scikit-learn

  $ sudo apt install python3-sklearn

チュートリアルのダウンロード・展開

$ wget https://bitbucket.org/kino_h/mi_python_tutorial_2020_public/get/10b86d126f56.zip
$ unzip 10b86d126f56.zip

チュートリアルの実行:

$ cd kino_h-mi_python_tutorial_2020_public-10b86d126f56
$ ipython notebook

0000.0010.Contents.ipynbにチュートリアルの一覧があります。回帰、クラスタリング、分類、次元圧縮、網羅探索、画像再構成、構造探索、ベイズ最適化、ベイズ回帰などのチュートリアルが用意されています