レビュー
Last Update:2025/10/03
NaClの差電子密度と結晶構造の可視化
1. はじめに ここでは、VirtualBox版のMateriApps LIVE !上でOpenMX Ver. 3.9 を使用し、その出力結果をOpenMX Viewerによって可視化した際の体験記を書きます。OpenM…続きを読む
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OpenMX Viewer
[おーぷんえむえっくす びゅあー]
OpenMX Viewer (Open source package for Material eXplorer Viewer) は結晶構造や分子構造を可視化するウェブベースのGUIプログラムです。OpenMX Viewerのウェブサイト上にcifファイルやOpenMXのインプットファイルをドラッグ＆ドロップするだけで構造を可視化することができます。
xyz, cif, OpenMX input/output の他に、構造最適化やMolecular dynamicsの結果を保存したmdファイルを読み込みアニメーションを再生したり、cubeファイルから3次元等値面を可視化したりすることができます。