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MateriApps Installer

  • 公開度：3 ★★★
  • ドキュメント充実度：2 ★★☆

オープンソースの計算物質科学アプリケーションやツール類を、macOSをはじめ、Linux PCやクラスタワークステーション、さらには国内の主要なスパコンシステムにインストールするためのシェルスクリプト集。東大物性研の全国共同利用スパコンでも、MateriApps Installerを用いて主要アプリケーションがプレインストールされている。

MateriApps Installerを用いた物性研システムC (enaga)へのアプリケーションのインストール
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MateriApps 開発チーム

Basic information / 基本情報

  • Install target directory / インストール先 (PREFIX)
    • /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y
  • Build directory / ビルドディレクトリ
    • $HOME/build
  • Support of C++1y / C++1yサーポート: Yes
  • Compiler / コンパイラ
    • module intel/18.0.3 (for compilation of applications / アプリケーションコンパイル用)
    • module gcc/7.2.0 (for compilation of tools / ツールコンパイル用)
  • MPI
    • module mpt/2.17 (MPI Library / MPIライブラリ)
  • CMake
    • module cmake/3.9.4
  • BLAS/LAPACK
    • module intel-mkl/18.0.3 (MKL Library / MKLライブラリ)
  • HDF5
    • Use MateriApps Installer / MateriApps Installer でインストールする
  • Python
    • Use MateriApps Installer / MateriApps Installer でインストールする
  • Git
    • Use git 2.14.3 installed by default / デフォルトでインストールされている git 2.14.3 を使う

Download of MateriApps Installer / MateriApps Installer のダウンロード

$ mkdir -p $HOME/build
$ cd $HOME/build
$ wget -O https://github.com/wistaria/MateriAppsInstaller/archive/master.tar.gz | tar zxvf -
$ mv MateriAppsInstaller-master MateriAppsInstaller

Configuration files / 設定ファイル

  • Create $HOME/.mainstaller / $HOME/.mainstaller を作成 
    $ cat << EOF > $HOME/.mainstaller
PREFIX=/home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y
EOF
  • Create /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/env.d/00_local.sh / /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/env.d/00_local.sh を作成 
    $ mkdir -p /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/env.d/
$ cat << EOF > /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/env.d/00_local.sh
eval \`/usr/bin/modulecmd bash remove intel gcc mpt intel-mkl cmake\`
eval \`/usr/bin/modulecmd bash load intel/18.0.3 gcc/7.2.0 mpt/2.17 intel-mkl/18.0.3 cmake/3.9.4\`
eval \`/usr/bin/modulecmd bash list\`
EOF

Install tools using MateriApps Installer / MateriApps Installerによるツールのインストール

  • 00_env 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/00_env/default.sh
  • 10_hdf5 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/10_hdf5/default.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/10_hdf5/link.sh
  • 11_eigen3 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/11_eigen3/default.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/11_eigen3/link.sh
  • 20_python 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/20_python/intel-mkl.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/20_python/link.sh
  • 21_python3 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/21_python3/intel-mkl.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/21_python3/link.sh
  • 25_boost 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/25_boost/intel.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/25_boost/link.sh
  • 40_alpscore 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/40_alpscore/intel_cxx1y.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/40_alpscore/link.sh
  • 70_alps 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/70_alps/intel-mkl.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/70_alps/link.sh
  • 72_openmx 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/72_openmx/intel-mkl.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/72_openmx/link.sh
  • 78_hphi 
    $ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/78_hphi/intel.sh
$ sh $HOME/build/MateriAppsInstaller/78_hphi/link.sh

How to use / 使い方

  • Tools (python, python3, etc) 
    $ source /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/env.sh

    Bashの設定ファイル($HOME/.bash_profile)に書いておくと良い

  • Check version of installed software / インストールされているバージョンの確認 
    $ check_maversion
  • ALPS 
    $ source /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/alps/alpsvars.sh
  • HΦ 
    $ source /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/hphi/hphi.sh
  • OpenMX 
    $ source /home/issp/materiapps/intel18.0-gcc7.2-cxx1y/openmx/openmx.sh

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